חופש המצפון הוא הזכות היסודית של כל אדם להחזיק, לפעול לפי ולבטא את אמונותיו המוסריות, האתיות או הדתיות הבסיסיות ללא התערבות ממשלתית או כפייה חברתית. הוא טוען כי העמדות העמוקות ביותר של האדם שייכות אך ורק למוחו ולמצפונו שלו, מה שהופך זאת לאבן יסוד של חופש אישי וכבוד אנושי.
מבחינה היסטורית, עיקרון זה שימש כאבן היסוד לחופש דת מודרני וחופש בעולם, והבטיח שקולות של מיעוטים יוכלו להתקיים בבטחה בתוך תרבות רוב. היום, הוא נותר חיוני להגנה על גיוון אינטלקטואלי, המאפשר לאנשים לחיות בהיותם עצמם בהתאם לערכיהם, ובמניעת הכפיית המדינה על אזרחים לפעול בניגוד לעקרונותיהם העמוקים.
